O game começa com Ratchet e Clank terminado uma partida de jogo, no qual Ratchet sai perdendo. Logo em seguida, Clank liga a televisão e inicia-se um vídeo. Após o vídeo, Ratchet muda de canal para o noticiário e assiste a um boletim informando que o planeta Veldian está sendo atacado por extraterrestres da raça [...]